Radio-frekvencijska identifikacija ili RFID nudi prednosti relativno niske cijene u usporedbi s drugom bežičnom tehnologijom, budući da je fizički neupadljiva i omogućava detaljno praćenje zaliha. Međutim, RFID nije bez svojih ograničenja na temelju robe koju prati i metoda korištenih za omogućavanje njezinih značajki.
Trošak
Iako RFID oznaka može koštati i nekoliko centi, a trošak je s vremenom opao, još uvijek je potrebno ulaganje u dobro, što se ne isplati uvijek. Iako je RFID oznaka korisna za označavanje i praćenje, ekonomski nije isplativa za označavanje robe vrlo male vrijednosti. Ovo je poseban problem s aktivnim oznakama (onima kojima je potreban lokalni izvor napajanja), a koje mogu koštati i dolar.
Sudar signala
Izvještaj iz veljače 2011. za "International Journal of Computer and Electric Engineering" napominje da nije lako istovremeno čitati više RFID oznaka. To može dovesti do toga da se različiti signali s oznaka međusobno ometaju. Kompjuterizirane tehnike za "raščlanjivanje" takvih signala, ali njihova primjena i upravljanje povećavaju operativne troškove.
Standardi
U članku IJCEE napominje se da RFID nema posebno čvrste i fiksne tehničke standarde. Nedostatak standarda problem je kada tvrtke pokušavaju podijeliti RFID informacije i praćenje s drugim organizacijama. Izvori potencijalnih razlika uključuju brzinu prijenosa podataka i tehnike upravljanja s kolizijom signala.
Frekvencije
Raspon korištenih bežičnih frekvencija razlikuje se u tri primarne regije - Americi; Azija i Australasia; i Europi i Africi. Varijacije u rasponima ograničavaju tvrtke koje žele koristiti RFID praćenje za međunarodno upravljanje zalihama. "Crossover" frekvencije djeluju posvuda, ali tvrtke moraju unaprijed planirati upotrebu ovih vrsta frekvencija pri odabiru oznaka i opreme.